Workshop: DNA sequence analysis

(Please note that currently the descriptions of programs taught in German (or in both German and English) are offered in German only.)

Eine Entdeckungsreise in die Welt der Gene

Dieser Workshop gibt Beispiele, wie Bioinformatik-Software von Wissenschaftlern im Bereich Life Science (Biologie, Biochemie, Medizin) genutzt wird. Hier ist nur ein kleiner Ausschnitt aus der anwendungs-orientierten Bioinformatik gezeigt. Bioinformatik als Fach umfasst natürlich weitere Gebiete. Weitere Informationen zu Forschungsinhalten der Bioinformatik und zu Studienmöglichkeiten an der Universität Hamburg sind unter "Informationen für Schülerinnen und Schüler" zu finden.

Für die Entdeckungsreise benötigt man:

Neugierde
einen Computer mit Internetzugang
die Programme ClustalX und Dendroscope
(Installationsanleitung im Reiseführer)Englischkenntnisse (Mittelstufenniveau)
1 Stunde Zeit für das Stöbern im Reiseführer und für die Installation der Programme
1 - 2 Stunden Zeit "am Stück" für Aufgaben 1.1-1.2-1.3
1 - 2 Stunden Zeit "am Stück" für die Aufgaben 1.1-1.2-1.4-1.5, wobei 1.5 auch weggelassen werden kann.

Die Entdeckungsreise ist für Schüler (11. und 12. Jahrgang) und interessierte Laien so verfasst, dass die Reise auch zu Hause durchgeführt werden kann.

Download der Workshopunterlagen als PDF-Dokument (ca. 1MB).

Dieses Dokument enthält mehrere Teile:

Der Reiseführer gibt die Hintergrundinformationen. Hier kann nachgelesen werden, wie Gene aufgebaut sind, was ein Alignment ist und auch wie man die benötigten Programme installiert. Der Reiseführer sollte nur dann gelesen werden, wenn etwas unklar ist oder wenn etwas so spannend ist, dass man gern Zusatzinformationen hätte.
Die Landkarte gibt es mit 2 Routen (Touren), 1.1-1.2-1.3 und 1.1-1.2-1.4-1.5. Sie ist die Wegbeschreibung und verweist an vielen Stellen auf den Reiseführer, der dann die Sehenswürdigkeiten erläutert

Dieser Kurs wurde von Sascha Steinbiß und Ute Willhöft (ehemalige Mitarbeiter am ZBH) entwickelt.

Aktueller Kontakt:

Prof. Stefan Kurtz

Dateien

mstn-mRNA.fas
mstn-protein.fas
mstn-genome.fas
unknown-proteins.fas
bmp2-protein.fas
mstn-bmp2-protein.fas
Fruchtfliege-protein.fas
Gelbfiebermuecke-protein.fas

Alle Dateien als Zip-Archiv.