Thorben Reim
Doctoral student
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Forschungsprojekt
Protein Dynamics under Non-Ambient Conditions
Die Flexibilität von Proteinen spielt eine zentrale Rolle bei enzymatischen Aktivitäten, deren Regulation, der Bindung von nativen Liganden und Medikamenten und weiteren biomolekularen Prozessen. Daher ist die Untersuchung von Proteindynamik eine Voraussetzung für das Verständnis dieser Mechanismen. Eine Temperatur-Sprung-Methode wurde entwickelt, um zeitaufgelöste Röntgenkristallstrukturen zu erhalten und somit Proteine in Bewegung analysieren zu können. Die gewonnenen experimentellen Daten können mit in silico Methoden, wie Molekulardynamik-Simulationen, verglichen werden, um anschließend die Auswirkungen verschiedener Störungen auf das Proteinverhalten zu analysieren, Vorhersagen der Proteindynamik zu ermöglichen und generische Modelle der Proteinflexibilität zu erstellen.