News21. Januar 2022|AMD NewsNew Paper: Comparison of Combinatorial Fragment Spaces and Its Application to Ultralarge Make-on-Demand Compound CatalogsFoto: Louis BellmannComparison of Ultralage Make-on-demand compound catalogs for the first time Calculating the compound overlap of two or more chemical libraries is a...15. September 2021|AMD NewsNew Paper: Searching Geometric Patterns in Protein Binding Sites and Their Application to Data Mining in Protein Kinase StructuresFoto: Figure: The human kinome trees in this figure were created with KinMap (http://www.kinhub.org/kinmap/)Protein kinase research encounters several challenges, the most serious one being the improvement of inhibitor selectivity through compound...9. September 2021|AMD NewsNew Paper: Maximum Common Substructure Searching in Combinatorial Make-on-Demand Compound SpacesFoto: Robert SchmidtMaximum Common Substructure (MCS) Searches are a common problem in Cheminformatics.For the first time, we (AMD group, Prof Rarey) provide a tool...23. August 2021|ZBH NewsNew Paper: DeepGRP: engineering a software tool for predicting genomic repetitive elements using Recurrent Neural Networks with attentionRepetitive elements contribute up to 50% of eukaryotic genomes.So identifying and classifying repeats is an important step in genomeannotation. In...27. April 2021|New PaperNew Paper: Quasi-Newton Numerical Optimizer with *Knowledge-Driven* Step-Length Control on Input Parameter Space (LSL-BFGS)For a better numerical optimization of molecular systems, we (AMD group, Prof. Rarey) developed a variant of the BFGS algorithm enabling *the...7. April 2021|AMD NewsNew paper in Science journalFoto: DESY, Sebastian GüntherAt the high-brilliance X-ray light source PETRA III of the Deutsches Elektronen Synchrotron, researchers were screening repurposing libraries for...26. Januar 2021|AMD NewsSpaceLight on JCIM CoverFoto: ACSThe January Issue of Journal of Chemical Information and Modeling features the ZBH publication on the software SpaceLight on its cover. SpaceLight is...26. Januar 2021|AMD NewsThe Quest for Computing Disconnected Maximum Common Substructures under ConstraintsFoto: Robert SchmidtThe maximum common substructure (MCS) problem has many applications in science. In cheminformatics, it is used to detect molecules with common...18. November 2020|AMD NewsMatthias Rarey talks at CSSB Seminar SeriesProf. Matthias Rarey talks at CSSB-Seminar virtual event about "Next Generation Computational Tools for Structure- and Ligand-Based Design": https://w...17. November 2020|AMD NewsShape-Based Descriptors for Efficient Structure-Based Fragment Growing - New publication in the Journal of Chemical Information and ModelingFragment growing is an important paradigm in computer-aided drug design. To improve the speed and interactivity of fragment growing workflows, which...16. Oktober 2020|AMD NewsSMARTS.plus - Neue Publikation in Molecular InformaticsDer neue SMARTS.plus Webserver bietet neben der Möglichkeit zur Visualisierung komplexer chemischer SMARTS zusätzlich die Möglichkeit des...23. September 2020|ZBH NewsMit Algorithmen auf MedikamentensucheFoto: CDC/ Alissa Eckert, MS; Dan Higgins, MAMJan Baumbach, Professor für Experimentelle Bioinformatik an der Technischen Universität München, hat eine Analyseplattform entwickelt, mit der...Beitrag aus dem News-Kanal MIN11. August 2020|AMD NewsVortragsreihe zu COVID-19 startetFoto: UHH/WohlfahrtAb Mitte August berichten Forschende aus Hamburg alle zwei Wochen über ihre Forschungen zu SARS-CoV-2 und COVID-19. Auch Wissenschaftlerinnen und...Beitrag aus dem Newsroom der Universität20. April 2020|AMD NewsProteinsPlus – Neue Publikation in Nucleic Acids ResearchDer ProteinsPlus Webserver verfügt über eine Vielzahl an Softwarewerkzeugen zur Untersuchung, Ähnlichkeitssuche und Anreicherung von...4. Februar 2020|AMD NewsHamburg-X: Neues Zentrum für Data Science in den NaturwissenschaftenIm Rahmen der Landesforschungsförderung Hamburg-X entsteht das 'Center for Data and Computing in Natural Science' (CDCS). Es wurde gemeinsam mit dem...21. Januar 2020|AMD NewsMatthias Rarey mit Armin Iske im Abendblatt-Interview: "100 große Fragen: Wie weit steuern Algorithmen unser Leben?"Zum 100-jährigen Jubiläum der Universität Hamburg veröffentlicht das Hamburger Abendblatt wöchentlich Beiträge von Wissenschaftlern der Universität...7. November 2019|AMD NewsPosterpreis für Robert Schmidt und Anna Lina Heinzke auf der GCCAuf der diesjährigen German Conference on Cheminformatics (GCC) in Mainz wurden Robert Schmidt und Anna Lina Heinzke aus der Arbeitsgruppe von...30. September 2019|AMD NewsdeNBI-Workshop zum Thema ProteinsPlus, BRENDA und KNIMEAm 23. und 24. September 2019 fand ein de.NBI-Workshop zum Thema Proteinstrukturen statt...17. September 2019|AMD NewsMatthias Rarey zum Vice-Chair/Chair GRC CADD gewähltMatthias Rarey wurde zum Vice-Chair 2021 / Chair 2023 der Gordon Research Conference on Computer-Aided Drug Design (GRC CADD) gewählt. Gordon...12. April 2019|AMD NewsSave the Date: RDKit User Group Meeting (RDKit UGM) am ZBH der Universität Hamburg vom 25.9 - 27.9RDKit ist eine freie Softwarebibliothek, die im Bereich der Chemieinformatik sehr weit verbreitet ist. Die Nutzer des RDKits organisieren sich in...Zum Archiv
