Dr. Kai Sommer
Alumni
Anschrift
Universität Hamburg
Forschungsprojekt
Interaktive Optimierung von Protein-Ligand-Komplexen aus Docking Experimenten
Eine effiziente Generierung von sinnvollen bioaktiven Ligandkonformationen ist mit voll-automatisierten Verfahren nur schwer zu erreichen, da sich die bioaktive Konformation je nach Zielprotein unterscheiden kann. Die direkte Berücksichtigung verschiedener sterischer sowie physikochemischer Randbedingungen bei der Konformationsgenerierung stellt ein schwieriges Optimierungsproblem dar. Durch die Kombination von interaktiven Verfahren mit automatischen Optimierungsalgorithmen soll der Optimierungsprozess beschleunigt und die Ergebnismenge optimiert werden.