Dr. Joel Graef

Forschungsprojekt

Methoden zum geometrischen Suchen in Proteinstruktursammlungen

Das Verständnis und die Manipulation von Proteinfunktionen erfordert umfangreiche strukturelle Kenntnisse über die Proteinbindungsstellen. Trotz des beträchtlichen Wachstums in der Anzahl verfügbarer Proteinstrukturen und der Verbesserung der Datenqualität gibt es nur eine kleine Anzahl von Werkzeugen, die geometrisches Data Mining der Protein-Ligand-Interfaces unter Hinzunahme chemischer Beschreibungen ermöglichen. Durch die Entwicklung neuer Algorithmen und unter Nutzung von Datenbanktechnologien soll eine schnelle und flexible geometrische Suche in Protein-Ligand- und Protein-Protein-Interfaces ermöglicht werden.