Jonathan Pletzer-Zelgert

Forschungsprojekt

Etablierung und Evaluierung von Proteinflexibilität in Posenvorhersagen durch molekulares Docking

Molekulare Dockingalgorithmen, die die Bindung von kleinen medikamentenähnlichen Molekülen an Proteine vorhersagen haben eine große Relevanz im computergestützten Wirkstoffentwurf. Während aktuelle Methoden die korrekten Posen bereits gut vorhersagen, wenn die Bindetaschenkonformation während des Bindungsevents erhalten bleibt, sind Bindungen, die Umlagerungen innerhalb der Proteinseitenketten oder des Backbones enthalten, schwer vorherzusagen. Ziel des Forschungsprojekts ist es Methoden zu entwickeln, die die Seitenkettenflexibilität in die Optimierung von Posen mit einzubeziehen und somit die Genauigkeit aktueller Dockingalorithmen zu erhöhen.