Prof. Dr. Matthias Rarey

Sekretariat

Prof. Dr. Matthias Rarey leitet das Zentrum für Bioinformatik an der Universität Hamburg, Deutschland.

Er ist Informatiker (M.Sc. Paderborn, 1992, Ph.D. Bonn, 1996) mit den Schwerpunkten Bio- und Chemieinformatik. Bis Juli 2002 war er Gruppenleiter für Chemieinformatik am Fraunhofer-Institut für Algorithmen und Wissenschaftliches Rechnen (SCAI, früher Teil der GMD). In den Jahren 1997 und 2000 forschte Prof. Rarey in den Chemoinformatik-Abteilungen von SmithKline Beecham (King of Prussia, PA) und Roche Bioscience (Palo Alto, CA). Prof. Rarey ist Mitbegründer des Chemieinformatik-Unternehmens BioSolveIT GmbH mit Sitz in Sankt Augustin. Seit 2002 leitet er das Zentrum für Bioinformatik an der Universität Hamburg. Seine Forschungsgruppe für Algorithmisches Molekulares Design befasst sich mit der Entwicklung neuer Algorithmen für Probleme des Moleküldesigns, innovativen Ansätzen der Chemieinformatik und neuen molekularen Visualisierungstechniken. Seit 1993 entwickelt Prof. Rarey innovative Software-Tools für struktur- und ligandenbasiertes Moleküldesign, von denen einige internationale Anerkennung gefunden haben, z.B. FlexX, Features Trees, PoseView, SMARTSeditor, Mona, ProToss und HYDE.  Mit neuartigen Tools wie SpaceLight, SpaceMACS und FastGrow haben Prof. Rarey und seine Gruppe den Grundstein für eine effiziente Cheminformatik in chemischen Fragmenträumen gelegt. Zum ersten Mal wurden Standard-Chemieinformatik-Aufgaben wie die Ähnlichkeitssuche und die Suche nach maximal gemeinsamen Substrukturen in riesigen Make-on-Demand-Verbindungskatalogen wie dem Enamine REAL space und anderen ermöglicht.

Von 2014 bis 2023 war Prof. Rarey Associate Editor des Journal of Chemical Information and Modeling der American Chemical Society. Darüber hinaus ist er Mitglied in den wissenschaftlichen Komitees von Wire Computational Molecular Science und dem Journal of Molecular Graphics and Modelling sowie in mehreren nationalen und internationalen Konferenzprogrammkomitees. In Hamburg ist er einer der Sprecher der Helmholtz-Data-Sciene-Graduiertenschule DASHH, die von DESY, UHH und TUHH gemeinsam mit sechs weiteren Partnerinstituten betrieben wird. Er leitet das neu gegründete Center for Data and Computing in Natural Science (CDCS) in Hamburg. Als Mitglied des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik-Infrastruktur de.NBI vertritt er die deutschen Aktivitäten zur 3D-Bioinformatik in der Interessengruppe ELIXIR 3D-Bioinfo. Seit 2021 ist er Mitglied des wissenschaftlichen Beirats der Abteilung Molecular and Cellular Structure des European Bioinformatics Institute.

Gemeinsam mit seinen Kollegen hat Prof. Rarey die Studiengänge M.Sc. Bioinformatik und B.Sc. Computing in Science aufgebaut und ist Mitglied in deren Prüfungsausschüssen sowie Verantwortlicher für den Studiengang M.Sc. Bioinformatik. Prof. Rarey ist Mitglied des Fakultätsrates der Fakultät für Mathematik, Informatik und Naturwissenschaften, er leitet die Promotionskommission der Fakultät für Informatik. Er war von 2011 - 2023 Vertrauensdozent für die Studienstiftung des deutschen Volkes.